Yo creo q es porque tienes que desactivar el grabado en una de las pistas, un botón rojo con un circulillo. Eso hace q en esa pista se graben cosas- No sé si será eso lo q preguntas
O si no, tambien puede ser que tengas que "mutear" (silenciar) la pista que ya tenias grabada (click en la "m" pequeñita que hay al lado de la "s") para que no la grabe...
mira el enrutamiento de la pista. En principio, si desarmas la pista (lo que decía monitus del circulito rojo), no debería colársete nada más que lo que tienes.
Yo estoy casi seguro de que es un problema de configuración de la tarjeta de sonido... mira a ver de dónde coge el sonido para grabar, deberías tener activada solo la opción "micrófono", "captura" o "entrada de línea" según la tarjeta.
También puede ser que tengas bien configurada la tarjeta, pero tengas dos tarjetas de sonido (la de la placa y una externa, por ejemplo) y el cubase te esté seleccionando la que no debe...
¡¡Suerte!!
lo mismo es algo en preferencias que esta mal configurado... yo estoy descargandomelo, cuando lo tenga ya comento, Saludos!