El tema es que en este caso hay una diferencia entre lo que es correcto y lo que se dice
Segun la rae:
Por lo que evidentemente esta bien dicho sobrino segundo y ademas es lo adecuado segun tu preguntas.
Lo que pasa es que el ser humano esta acostumbrado a la economia lingüistica, aunque el ministerio de igualdad quiera cargarsela, y por ello simplemente a todos los familiares que no sean directos generalmente se les llama primos y punto, sin siquera utilizar lo de segundo. No conozco a nadie que se encuentre por la calle con otra persona y le diga "hola sobrino tercero ¿como estas?"
¿O acaso no lo haceis asi vosotros?