Exactamente es debido a la afinacion. Ese eco como tu lo llamas es lo que se llama "sustain", y para reducirlo tienes varias opciones: afinar hasta que se quede a tu gusto (puede que tardes, pero suele ser la mejor opcion), usar parches de doble capa o con apagadores (como los Evans EC2, por ejemplo), o usar apagadores (Moongel, sordinas, etc.)
Sin embargo los apagadores te los recomendaria como ultima opcion, pues aunque es una forma rapida de quitar mucho sustain y dejar un sonido mas seco, siempre me ha parecido que matan el sonido de la bateria, pero tambien es verdad que es cuestion de gustos.